由于物流涉及的领域太广，物流发展需要协调的部门太多，所以，多年来物流专家们一直强调“物流成败在体制”。

事实上，我国物流管理体制的变革一直在推进，综合交通运输体系建设卓有成效。我国目前基本上确立了交通运输部在物流管理方面的主体地位，也为物流业的发展和运行提供了体制上的保障。但是，物流运行管理机制的完善还有很长的路要走。

现行的国家物流运行管理机制是2005年经国务院批准的全国现代物流工作部际联席会议制度。目前由国家发改委牵头，工信部、商务部、交通运输部、公安部、财政部、海关总署、工商总局、税务总局、质检总局、国家标准委、中国物流与采购联合会、中国交通运输协会等部门和单位组成。其职责是全面掌握全国现代物流发展情况，分析发展中存在的问题；综合协调涉及现代物流发展的政策、战略和规划；统筹推进现代物流标准化、信息化、统计指标体系、人才培养等基础性工作；指导各省、自治区、直辖市人民政府及其职能部门的现代物流工作；协调解决涉及相关部门的有关问题，促进部门协作配合，实现信息共享，建立长效机制，全面推进现代物流工作。

各地的物流管理机构和运行机制差别较大，基本上参照国家的做法，成立了地方物流工作联席会议制度，但同时根据当地的实际情况，做了不同的安排，主要体现在物流主管部门不尽相同。例如，深圳主抓物流发展工作的是交通部门，江苏、四川等省份则是经贸部门，成都先是在经贸部门，后来又提升为市政府物流办公室。由于物流管理尚未建立上下对接的运行机制，地方工作协调难度很大。物流主管部门不同，政府授权的程度不同，物流发展推进的力度也不尽相同。实践证明，我国现阶段区域物流发展好坏与政府主导密切相关，物流发展较好的省份都在运行机制上有所创新。这取决于各地物流产业在当地的重要程度，包括区位、交通、绩效等具体情况，以及决策者们对物流业的认知程度和作为程度。

无锡物流业发展条件和优势明显，各地对物流运行管理机制都做了一些有益的探索，总体上应是提升组织管理，创新工作机制。一是整合发改委、经信委、政府口岸办、交通运输等部门力量，明确综合协调、通道建设、项目推进等职能。二是工作要常态化，在统一思想认识的前提下形成工作规范，包括强化规划引导、配套扶持政策，建立物流统计、企业联系、技术认定等制度，搭建供需对接、区域联动、成果展示等平台。三是突出工作重点，即加快物流通道建设，包括加密航线网络、增开铁路班列、发展货运班车等；加快交通设施建设，包括加快枢纽机场设施、铁路货运设施和区域高速路网的建设；加快物流园区建设，包括物流先导与产业集聚的同步推进、开放引进大商强企、物流枢纽项目的审查和保障等；加快口岸物流发展，形成口岸服务体系，推动航空、铁路、水路、公路口岸与出口加工区、保税物流中心和综合保税区的区间联动；谋划和支持物流新业态及高端物流的发展，做好电子商务物流产业园、冷链物流港、临空经济区等的规划。同时，加强动态的物流布局谋划，上下联动，彰显各地特色。四是理顺各方工作关系，全面推进，包括加强与周边地区和城市的合作；围绕物流发展中心工作管好用好协会；组织高校、科研院所开展物流技术、管理和咨询服务；组织媒体开展宣传、讨论，形成社会共识；净化执法环境；维护物流市场秩序，保障物流企业的公平竞争等。