中物联指出，物流业是充分竞争的行业，物流企业平均利润率呈逐年下降趋势。仓储企业为3%-5%，运输企业为2%-3%，货代和一般物流服务的利润率仅为2%左右。而企业税收负担却高于全国宏观水平，税收支出的增长速度又快于营业收入和利润增长。较低的利润率和较高的税收负担，导致大型企业缺乏发展后劲，小型企业难以为继。

　　2012年以来，营业税改征增值税逐步在全国推开，物流企业税收负担进一步加重。特别是交通运输服务税率设置，从营业税体制下的3%上升到增值税体制下的11%，再加上抵扣不足，导致物流业尤其是从事交通运输服务的企业税负增加较多。与原来的营业税体制相比，多数企业增加一倍左右。

　　此外，财政部和国家税务总局2010 年发布的《关于安置残疾人就业单位城镇土地使用税等政策的通知》（财税〔2010〕121号）提出，将地价计入房产原值征收房产税。不仅形成了房产占地实际上的重复纳税，也进一步加重了企业的税收负担，而且在执行中也会产生地价确定标准不统一等征管问题，不利于仓储型物流企业的健康发展。