目前国内新鲜瓜果菜主要依靠汽运，大部分果蔬未经冷藏保鲜处理就进行长途运输，导致运输过程中的平均损耗率达20%以上。生鲜农产品运输耗损率高，导致了流通成本相应提高。在生鲜食品的整个运输过程中，中国的损耗大约是20%-30%，在发达世界，比如说日本或者美国，其实这个损耗不到2%，这个实际上是十几倍，甚至二十倍的损失，那么这个成本也会加到最终食品的成本里面。
　　资料显示，我国总体来看冷链运输率不足10%。农业部的统计，其中每年仅仅是水果蔬菜因此损耗700亿元。大多数国家减低损耗的办法是进行冷链运输。以美国为例，平均每一万人配备冷藏车数大约9辆，在中国按目前市场的冷藏保有量来看，大约是每万人2辆。在中国，所有在运输过程中应该实施温度控制的食品中，只有15%的产品做到了。而在美国和欧洲，这个比例是85%。
　　美国基本每人的冷藏体大约是16个立方英尺，实际上按立方米算的话，实际上是1-2个立方米，那么实际上中国是差不多只有这个美国的每个所拥有冷藏储藏的十分之一。
　　伴随着城市规模的不断扩大，供应鲜活食品的难度确实也是越来越大。随着城市的发展，想解决这个问题，越来越难。原因之一是我们传统的饮食观念，以及以往的冷库的容量和加工冻的设备不够先进，温度不够低。无论是海鲜和生肉，能够在零下50度速冻起来的话，鲜活程度也是可以保证的，不过现在各地冷库的数量和质量是制约整个冻品产业发展的瓶颈。
成本始终是冷链运输的门槛。在高成本运输的情况下，有些物流公司在冷藏温度上动歪脑筋，冷藏食品达不到温度要求，甚至是有些需要冷冻的食品，干脆放在冷藏室里运输，导致食品在运输过程中出现质量问题。我们知道在冷炼的储藏过程中有几种不同的要求。比如说有极度深冷的，比如说-3度到-48度的，有的可能是属于冷藏级别的，-4到-10度的。比如说肉类的话，可能-4度-10度;水果可能是-2度到0度左右，或10度。在中国呢，通常一个冷库它的温控是一定的，所以不管是冷藏的还是冷冻的东西，都在这里面。这时候有的就会发现，不需要冷藏、不需要冷冻的它放到冷冻库里了，这样会大量的增加电量的消耗，那么需要冷冻的它放到属于冷藏的仓库里了，那么温度又达不到。也会造成我刚才说的毁坏现象，所以这是我们经常见的，冷链过程出现的一些问题。
　　集约化运输是减少冷链运输成本的一个办法。事先和收货企业做好了时间的约定，企业不但给物流公司留出了特定的收货时间，还空出了停车位来方便卸货。有了时间和空间的保障，没有了送货排队等候的的时间，送货的效率大幅度的提高了。国内很多老式冷库是开放月台式的，这在外行看来，不封闭的一块区域似乎减低了建筑用料的成本。但一方面，没有全封闭式的冷库和冷冻车辆对接导致了冷冻食品无法全程冷链运输，反而提高了冷链成本。他们后来改用了新建封闭冷库，发现冷链运输的成本降下来不少。这是因为它有效地建立了一个冻库和常温之间的缓冲带，那么从整体的一个运作效率来看，整个的电耗就会明显地下降。
　　在国外，日本的运输产业相对集中，冷链运输成本比其他国家低三分之一以上。而在美国等国家，同样面临冷链运输同样面临高成本的问题，为此，他们也有一些降低冷链运输成本的办法。很多在外国的冷库，这个冷藏车是可以开到冷库里面的，所以它在整个交界和操作过程中，是比如在冷库内进行的。在中国，通常在车辆停靠和仓储的环节有一段是大气环境，这个环境又取决于整个装卸过程的时间多长，可能装一个车装了6个小时，那这6个小时就失去了温度的保证，这很可能就直接导致了货品的损坏。