快件丢失、暴力分拣、安检存漏洞……随着这一系列快递黑幕被曝光，国家邮政局开始了对快递业的整顿“风暴”。2012年12月31日，国家邮政局公布注销了全国116家快递企业经营许可证，并发布通知，要开展快递服务质量专项整治活动，严肃查处快递企业损害消费者合法权益的行为，并要求快递企业春节期间正常揽收、分发快件。对于国内民营快递加盟分公司广泛采取的混包模式，也明确指出：“对未经许可违法经营快递业务，以及通过加盟、委托、承包等形式超出许可范围违法经营快递业务的行为，要依法严厉查处。”

同一天，交通运输部部长杨传堂主持召开部务会，通过了《快递市场管理办法(送审修改稿)》，对管理主体进行补充，并明确省级以下邮政管理机构对快递市场实施监督管理的职责，对开展快递加盟行为的双方资质、权利义务关系等内容进行了规范。

此外，国家邮政局还对媒体曝光的申通快递进行了调查和约谈。2012年12月26日，河南省邮政管理局对南阳申通快递进行了调查和走访；2013年1月4日，上海市邮政管理局针对外界反映的公司暴力分拣、客户信息泄露等问题，也约谈了上海申通快递。据悉，申通快递在约谈当日即提交了整改报告。