九州通集团致力于打造现代化物流信息技术的核心竞争力，经过多年的自主研发与实践创新，目前，九州通是国内唯一具备独立整合物流规划、物流实施、系统集成能力的医药分销企业，并取得了20多项自主知识产权，在现代物流技术和信息技术方面处于国内领先、国际一流的地位，是国内医药行业唯一获得“中国物流改革开放30年旗帜企业”和全国首家“5A级物流企业”称号的企业。
为了降低医药物流成本，提高经营产品的配送效率，减少差错率，早在2001年，九州通集团就开始进行现代医药物流流程以及相关物流技术的研究，并与国内外先进的物流集成商进行技术交流，探索将国内外先进的物流技术与中国医药物流的具体国情相结合的物流模式。
九州通集团制定了以“自主研发为主、外部合作为辅”的自主研发机制。在技术方面，该公司积极跟踪世界先进的物流技术，在充分论证的基础上，及时吸收消化，以提高物流管理系统的性能，并增强系统的可扩展性和可维护性，提高运营效率；在流程和功能方面，针对企业近期的要求和远期的规划，结合自身业务特点，逐步提高现有的物流及信息管理软件的性能，使物流及信息技术不断优化。
九州通集团已完成了旗下50余个现代化医药物流中心的建设，根据各个医药物流中心的不同功能，采用了现代物流设施、设备，研发了与之相匹配的物流管理系统和信息管理系统，并在医药物流中心规划、设备选型、系统集成、系统上线和搬迁等方面积累了丰富的实际经验，形成了仓储管理系统（WMS）、设备控制系统（WCS）、运输管理系统（TMS）等三大自主研发成果，并取得多项独立知识产权。
据赵立红介绍，即将投入建设的项目，包括现代医药物流中心板块和中药材物流中心板块，主要从事药品、医疗器械、中药材的批发和零售、电子商务、技术研发、网店孵化及中药材加工整理等。项目内将采用悬吊链仓库系统、仓储管理系统（WMS）和设备控制系统（WCS），使用移动台车收货设备、物流输送自动分拣设备和无线扫描设备等先进设备，实现电子标签拣选、自动化仓储等功能。
